◈ ProteinScore蛋白结合设计评价正在连接
FROM DESIGN TO EVIDENCE

让每一条设计，
都有可比较的依据。

给定靶点与设计，查看界面质量、结构置信度和序列性质。
支持已有预测直接评分，也支持从序列开始自动预测。

CHANGJIANG CUP / 2026

赛题已公布 · 7个独立赛道

EGFR · TNF-α · GLP-1R · TfR1 · TL1A · TNFR1 · IL-7Rα

查看官网要求、靶点序列与下载；补充问答按需查阅。

进入赛题专区 →

FOR PROTEIN DESIGN TEAMS

参赛设计，来这里评分与比较

带上你的靶点和设计，查看多维度分数，找到值得优先验证的候选。

从序列到评分

输入靶点与设计序列，由 Boltz-2 预测复合物；已有结构和 PAE 可直接评分。

看清每项依据

提供 ipSAE、ipTM、界面 PAE、iLIS 等指标与通俗说明。缺少的指标保留为空。

加入同靶点排名

匹配官方靶点后可选择公开入榜。同靶点、同评价配置分组比较，查看帕累托分层与优势。

提交设计评分 →查看设计排名 →选择模型生成 →文件批量提交 →

隐私：完整设计序列、结构与原始报告不进入公开排名；内部设计匿名，外部提交经同意展示所填名称与分数。

序列预测按队列和算力安排，当前上限为靶点与设计合计900个残基。已有结构评分无需等待GPU。本站为独立评价服务，赛事结果以官方评测为准。

MODELS & DESIGN ROUTES

谁生成设计，谁预测和评分？

生成：RFD4-Proteina

当前700条内部设计均由 RFD4-Proteina 生成。排名表可筛选生成模型、设计类型和框架；外部提交的模型来源按提交者声明记录。

复核：Boltz-2 ＋ OpenFold3

网页序列评分使用 Boltz-2；内部设计另做 OpenFold3 复折叠与组装检查。ipSAE、iLIS等是根据结构和置信度计算的评价指标。

本轮两类设计分别使用独立预设
类型与靶点生成方式正式参数与复核
VHH：EGFR、TNF-α、GLP-1R、TfR1、TNFR1使用抗体设计配置，以VHH框架和靶点为条件设计结合区域。四种框架：caplacizumab、ozoralizumab、vobarilizumab、h-NbBCII10；本轮每靶点各25条。60步，300次主干计算；生成后做ANARCII IMGT编号。OF3保留靶点与框架模板。
minibinder：TL1A、IL-7Rα不使用VHH框架，以靶点热点为条件设计整条结合链；本轮生成长度100 aa，每靶点100条。60步，180次主干计算；OF3保留靶点模板。官网允许40–100 aa。

外部序列提交可声明VHH或minibinder；长度合规不等于通过抗体编号、CDR新颖性或功能验证。两类应分别进行后续检查。

GENERATE NEW DESIGNS

选择模型，生成新的比赛设计

新设计使用服务器正式预设，生成后继续执行OpenFold3与Boltz-2复核。当前赛事任务优先；序列和结果通过私有回执访问。

默认每靶点100条。选择四框架时按框架和热点分配；相同靶点、种子与配置会复现相同采样方案。每条计算参数固定。

导入已有生成回执

COMPETITION / BATCH SCORING

比赛序列 · 文件批量评分

同一文件对应一个比赛靶点。上传多条设计，检查通过后整批入队；服务器按正式 Boltz-2 配置逐条评分。

FASTA：每条以 >设计名称 开头；CSV：两列 name,sequence。名称需唯一。模板中的占位文字须替换为你的实际序列。

这里选择已上传设计的来源模型；新设计生成请使用上方“选择模型，生成新的比赛设计”。

不勾选公开入榜时，结果通过你的私有回执访问。计算配置：200步、3次循环、5个样本，分数取中位数。队列满时整批暂不接收，不会只提交其中几条。

已有回执？恢复批次进度

选择后自动填入官方靶点序列，并切换到序列预测。切换靶点会清空旧设计，请填写自己的候选序列。

查看赛题要求与序列来源 ↗

这里是六组历史参考案例。比赛靶点请使用上方选择框。

链内顺序须与结构逐残基对应。支持标准蛋白复合物，最多1600个残基。

补充置信度信息

此项填写已有设计的来源模型。新设计请使用上方生成入口。

完整匹配比赛靶点后自动收录。序列与结构不公开；取消勾选可保留为私有评分。

上传文件不进入公开目录；加入排名的评分报告在服务器保留以便溯源。

评价报告

⌁

从一条设计开始

完成评分后，这里将呈现各项指标、推荐依据，以及同靶点候选的对比列表。

01 界面可信度02 接触与误差03 序列性质

评分怎么看，数据从哪里来

评分说明源码 ↗

    两种输入，三类数值

    输入序列：Boltz-2预测结构和置信度。上传结构：沿用你提供的预测文件。

    ipTM直接来自模型；ipSAE、iLIS等按公开方法从预测数据计算；界面指数是本站定义的组合排序分。

    综合推荐怎么得出

    界面指数 = 100 × (ipSAE + iLIS) ÷ 2；没有接触时为0。建议优先复核同靶点中指数较高、PAE较低且接触充分的候选。

    尚未用实测标签确定通用及格线，指数不转换为实验成功概率。

    逐项解释：12类指标的含义、方向与出处
    5个样本如何汇总，案例历史分数如何看

    原始论文、作者代码与阳性案例来源

      本次候选对比

      列表仅保留在当前页面；请比较同一靶点、相同预测流程的候选。记录按界面指数排序。

      设计模型长度界面指数ipSAEiLIS接触PAE ↓接触对
      尚无评分记录